Centru za mikrobiologiju obavlja javnu zdravstvenu mikrobiološku delatnost od interesa za šumadijski okrug, putem specifičnog laboratorijskog rada. U Centru za mikrobiologiju, izolacijom i identifikacijom ispituju se uzročnici zaraznih oboljenja standardnim mikrobiološkim metodama, automatizovanim metodama i serološkim testovima. Takođe prati se i analizira rezistencija bakterija i interpretiraju se rezulati.

Cilj Centra za mikrobiologiju je pružanje što kvalitetnije usluge pacijentima. Kvalitet rada i usluga je pod kontrolom kvaliteta i stalno se poboljšava. To podrazumeva kontrolu svih faza rada, redovni nadzor, otkrivanje i uklanjanje grešaka, unutrašnju proveru reagenasa, podloga, postupaka, opreme i osoblja.
Stručnost, osposobljenost i profesionalnost osoblja omogućava da se u Centru sprovodi dobra laboratorijska praksa sa visokim kvalitetom ispitivanja.